org-noter
Permite relacionar um arquivo org a um pdf. O org é usado como um arquivo pra manter as anotações relacionadas ao pdf.
O org-noter é tão bom que ele sabe onde estão as notas do pdf e se passarmos pela nota no pdf ele dá highlight no org e vice-versa.
Ele gera links pra a página ou numa altura específica, porém são links que só valem pro org-noter. Para links mais precisos e no formato geral de org-link é preciso usar o org-pdftools e org-noter-pdftools.